Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms