Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLEC4EQ9ULY5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms