Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA4

AKAP11, A-kinase anchor protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP11Q9UKA4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AKAP11Q9UKA4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
AKAP11Q9UKA4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AKAP11Q9UKA4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AKAP11Q9UKA4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AKAP11Q9UKA4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AKAP11Q9UKA4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
AKAP11Q9UKA4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
AKAP11Q9UKA4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms