Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNA3Q9UI47 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms