Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262.9 ms