Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD7Q9P2D1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD7Q9P2D1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms