Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP36Q9P275 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms