Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN8

CNOT2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2Q9NZN8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNOT2Q9NZN8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNOT2Q9NZN8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms