Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM161AQ9NX61 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM161AQ9NX61 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM161AQ9NX61 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms