Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW0

HCFC1R1, Host cell factor C1 regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1R1Q9NWW0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC1R1Q9NWW0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1R1Q9NWW0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.2 ms