Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GINM1Q9NU53 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms