Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf4Q9NR00 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C8orf4Q9NR00 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms