Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COG4Q9H9E3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COG4Q9H9E3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COG4Q9H9E3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms