Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSS3Q9H6R3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSS3Q9H6R3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.5 ms