Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC27Q9C0I9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC27Q9C0I9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC27Q9C0I9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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