Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
YTHDF1Q9BYJ9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
YTHDF1Q9BYJ9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF1Q9BYJ9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms