Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLDIP3Q9BY77 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms