Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5DQ9BY66 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5DQ9BY66 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5DQ9BY66 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5DQ9BY66 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5DQ9BY66 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM5DQ9BY66 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5DQ9BY66 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5DQ9BY66 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5DQ9BY66 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM5DQ9BY66 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5DQ9BY66 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5DQ9BY66 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5DQ9BY66 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM5DQ9BY66 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
KDM5DQ9BY66 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
KDM5DQ9BY66 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
KDM5DQ9BY66 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5DQ9BY66 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms