Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LSM14BQ9BX40 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSM14BQ9BX40 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM14BQ9BX40 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms