Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
HIRIP3Q9BW71 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HIRIP3Q9BW71 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms