Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP19Q99542 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP19Q99542 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms