Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EYA3Q99504 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EYA3Q99504 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EYA3Q99504 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms