Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARXQ96QS3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms