Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TEFMQ96QE5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TEFMQ96QE5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms