Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC9Q96Q05 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC9Q96Q05 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAPPC9Q96Q05 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms