Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RUNDC3BQ96NL0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC3BQ96NL0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms