Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGF29Q96ES7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGF29Q96ES7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms