Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RMDN1Q96DB5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RMDN1Q96DB5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RMDN1Q96DB5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms