Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDAQ92838 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDAQ92838 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDAQ92838 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDAQ92838 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDAQ92838 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDAQ92838 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDAQ92838 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDAQ92838 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDAQ92838 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDAQ92838 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDAQ92838 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDAQ92838 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDAQ92838 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDAQ92838 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDAQ92838 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDAQ92838 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDAQ92838 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDAQ92838 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDAQ92838 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EDAQ92838 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDAQ92838 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDAQ92838 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDAQ92838 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDAQ92838 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDAQ92838 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDAQ92838 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDAQ92838 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDAQ92838 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDAQ92838 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDAQ92838 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDAQ92838 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDAQ92838 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EDAQ92838 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDAQ92838 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDAQ92838 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDAQ92838 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EDAQ92838 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDAQ92838 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDAQ92838 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDAQ92838 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDAQ92838 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDAQ92838 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDAQ92838 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EDAQ92838 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EDAQ92838 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EDAQ92838 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EDAQ92838 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EDAQ92838 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EDAQ92838 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDAQ92838 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EDAQ92838 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDAQ92838 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDAQ92838 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDAQ92838 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDAQ92838 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDAQ92838 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EDAQ92838 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDAQ92838 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDAQ92838 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDAQ92838 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDAQ92838 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDAQ92838 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDAQ92838 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDAQ92838 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDAQ92838 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDAQ92838 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDAQ92838 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDAQ92838 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDAQ92838 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EDAQ92838 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDAQ92838 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDAQ92838 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDAQ92838 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDAQ92838 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDAQ92838 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDAQ92838 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDAQ92838 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EDAQ92838 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDAQ92838 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EDAQ92838 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EDAQ92838 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDAQ92838 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDAQ92838 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDAQ92838 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDAQ92838 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDAQ92838 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EDAQ92838 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EDAQ92838 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDAQ92838 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDAQ92838 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDAQ92838 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDAQ92838 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EDAQ92838 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDAQ92838 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDAQ92838 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDAQ92838 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDAQ92838 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDAQ92838 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EDAQ92838 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms