Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA4

GTF3C2, General transcription factor 3C polypeptide 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2Q8WUA4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
GTF3C2Q8WUA4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C2Q8WUA4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms