Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYRIPQ8NFW9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYRIPQ8NFW9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYRIPQ8NFW9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms