Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AGBL3Q8NEM8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGBL3Q8NEM8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGBL3Q8NEM8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms