Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAF1Q8N7H5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms