Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOT2Q8IXI1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOT2Q8IXI1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms