Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKD1L3Q7Z443 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PKD1L3Q7Z443 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms