Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
KNDC1Q76NI1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms