Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC73Q6ZRK6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC73Q6ZRK6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms