Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC141Q6ZP82 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms