Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC174Q6PII3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC174Q6PII3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC174Q6PII3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms