Protein–RNA interactions for Protein: Q6P474

PDXDC2P, Putative pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC2PQ6P474 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDXDC2PQ6P474 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDXDC2PQ6P474 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PDXDC2PQ6P474 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDXDC2PQ6P474 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDXDC2PQ6P474 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDXDC2PQ6P474 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDXDC2PQ6P474 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDXDC2PQ6P474 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms