Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUSD4Q5VX71 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms