Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE27Q5T4F4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZFYVE27Q5T4F4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms