Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP188Q5SRE5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP188Q5SRE5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms