Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO47Q5MNV8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO47Q5MNV8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms