Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SAMD9Q5K651 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SAMD9Q5K651 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SAMD9Q5K651 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SAMD9Q5K651 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SAMD9Q5K651 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SAMD9Q5K651 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
SAMD9Q5K651 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SAMD9Q5K651 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms