Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COBLL1Q53SF7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COBLL1Q53SF7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.3 ms