Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRY2Q49AN0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRY2Q49AN0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRY2Q49AN0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms