Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

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Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD9Q3L8U1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD9Q3L8U1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHD9Q3L8U1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHD9Q3L8U1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CHD9Q3L8U1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD9Q3L8U1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD9Q3L8U1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
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