Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MSMPQ1L6U9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSMPQ1L6U9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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