Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP6AP1Q15904 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP6AP1Q15904 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP6AP1Q15904 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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